Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dsg1cQ7TSF0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms