Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ScocQ78YZ6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ScocQ78YZ6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms