Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NinlQ6ZQ12 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NinlQ6ZQ12 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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