Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc4Q6S5L9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms