Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrn2Q6PHP6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms