Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad54bQ6PFE3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms