Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms