Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtifQ6PEE2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtifQ6PEE2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtifQ6PEE2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtifQ6PEE2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtifQ6PEE2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtifQ6PEE2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CtifQ6PEE2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms