Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx6Q6P8X1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx6Q6P8X1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms