Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Podnl1Q6P3Y9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Podnl1Q6P3Y9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms