Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Frg2f1Q6P3A2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Frg2f1Q6P3A2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms