Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rad17Q6NXW6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad17Q6NXW6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms