Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt72Q6IME9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms