Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ctnna3Q65CL1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ctnna3Q65CL1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms