Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PtprjQ64455 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprjQ64455 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PtprjQ64455 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms