Protein–RNA interactions for Protein: Q64343

Abcg1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg1Q64343 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg1Q64343 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg1Q64343 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Abcg1Q64343 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Abcg1Q64343 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcg1Q64343 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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