Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Surf4Q64310 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms