Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd1Q62101 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms