Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cd47Q61735 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd47Q61735 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms