Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd53Q61451 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd53Q61451 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms