Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp7Q60973 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp7Q60973 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms