Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tnfrsf8Q60846 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tnfrsf8Q60846 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms