Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ItgaeQ60677 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ItgaeQ60677 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms