Protein–RNA interactions for Protein: Q60641

Nr1h4, Bile acid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h4Q60641 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1h4Q60641 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms