Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd5Q5VCS6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd5Q5VCS6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms