Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp78Q5U406 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms