Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc42Q5SV66 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc42Q5SV66 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms