Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sft2d1Q5SSN7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Sft2d1Q5SSN7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms