Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf12Q5SPL2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Phf12Q5SPL2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms