Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1B6

Trav8d-2, T cell receptor alpha variable 8D-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav8d-2Q5R1B6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trav8d-2Q5R1B6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trav8d-2Q5R1B6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms