Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trdv4Q5R1A3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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