Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm5431Q5NCB3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5431Q5NCB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms