Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ecm2Q5FW85 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ecm2Q5FW85 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ecm2Q5FW85 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms