Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBG8

Uncharacterized protein C1orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5EBG8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q5EBG8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms