Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Nlrc3Q5DU56 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nlrc3Q5DU56 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms