Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtl5Q5DTT4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtl5Q5DTT4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms