Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Fam208bQ5DTT3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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