Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf354cQ571J5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf354cQ571J5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms