Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Opa3Q505D7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms