Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt35Q497I4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt35Q497I4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms