Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm906Q3V0M1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm906Q3V0M1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms