Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prdm6Q3UZD5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prdm6Q3UZD5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms