Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Syndig1lQ3USQ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Syndig1lQ3USQ7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms