Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm28047Q3US59 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28047Q3US59 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms