Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc190Q3URK1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc190Q3URK1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc190Q3URK1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc190Q3URK1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc190Q3URK1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc190Q3URK1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc190Q3URK1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc190Q3URK1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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