Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwa5b2Q3UR50 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vwa5b2Q3UR50 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms