Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
D13Ertd608eQ3UPR8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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D13Ertd608eQ3UPR8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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