Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Shisa3Q3UPR0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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