Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgef40Q3UPH7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgef40Q3UPH7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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