Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp30Q3UN04 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp30Q3UN04 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Usp30Q3UN04 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp30Q3UN04 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp30Q3UN04 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp30Q3UN04 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp30Q3UN04 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Usp30Q3UN04 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp30Q3UN04 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp30Q3UN04 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp30Q3UN04 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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